1959年1月，为了贯彻党的教育方针，检阅教学、科研、生产“三结合”的成果，电机工程系举行了全校首个系级科学报告会。

1978年1月10日，教育部发布《关于高等学校1978年研究生招生工作安排意见》，学校根据文件精神积极做好招收研究生的准备工作。经初试、复试电机工程系共录取10人，这是电机工程系第一次招收硕士研究生。

1982年1月3日，山东省教育厅（82）鲁高教字2号同意山东工学院建立学位评定委员会，电机工程系系主任丁长浩、系副主任常春馨，教师蒋仁渊、裘培勇入选山东工学院学位评定委员会。

1984年1月16日，国务院学位委员会下发《关于下达第二批博士和硕士学位授予单位名单的通知》，电机工程系“工业自动化”学科获得硕士学位授予权。

1991年1月13日，自动化工程系“工业自动化”学科被评为“八五”期间山东省属本科院校的省级重点学科。

1994年1月，学院教师李希霖、马思乐赴德国西门子公司进行计算机技术培训。

2001年1月，自动化工程系更名为控制科学与工程学院。贾磊任学院院长，李玲任学院分党委书记。周常森、张承慧任学院副院长，徐波、张振山任学院分党委副书记。学院下设三个教学系：自动化工程系、测控技术与仪器系、生物医学工程系；十个研究所和实验中心：电力电子技术研究所、模式识别与系统工程研究所、自动化研究所、生物医学工程研究所、电子新技术应用研究所、电子束研究所、过程控制研究所、自动控制研究所、自动化工程中心、实验中心、工程系统控制重点实验室。

2004年1月，学院党政领导班子换届。贾磊任学院院长，李玲任学院党委书记。周常森、李贻斌、李歧强、钟麦英任学院副院长，徐波、张振山任学院党委副书记。

2006年1月25日，国务院学位委员会下发《关于下达第十批博士和硕士学位授权学科、专业名单的通知》，学院“控制科学与工程”学科获批一级学科博士学位授予权，并自设“物流工程”硕士学位授权点。

2009年1月7日，学院1983届本科电机专业校友房建成当选“山东大学2008年度十大杰出校友”。

2021年1月，学院教师张海霞入选教育部“长江学者”特聘教授。

2022年1月，学院新能源系统控制团队入选“全国高校黄大年式教师团队”（牵头人：张承慧）。

2022年1月，学院党政领导班子换届。张承慧任学院院长，高瑞任学院党委书记，常发亮任学院常务副院长。朱文兴、孙波、宋锐、王光臣任学院副院长，吴晓晴、李文振任学院党委副书记。

2022年1月12日，中国科学院院士房建成（1983届本科电机专业校友）到访学院。

2024年1月3日，学院党政领导班子进行届中调整。张承慧任学院院长，吴晓晴任学院党委书记，王光臣任学院常务副院长。朱文兴、孙波、李岩、张伟任学院副院长，李文振、汤庆新任学院党委副书记。

2024年1月19日，学院1988届本科电气技术（师范）专业校友刘继忠被授予“国家卓越工程师”称号。

2024年1月29日，学院举办国家杰出青年人才新年座谈会。

2024年1月-3月，学院教师朱文兴获评2023年度山东省高等学校教学名师；自动化专业教研室获评省级示范性基层教学组织；自动化与智能系统实验教学中心和山东大学济柴动力实习基地分别入选省级实验教学示范中心（全校8个）和省级示范性实习（实训）基地（全校9个）。

2025年1月13日，学院召开人才发展与科技创新研讨会。

2025年1月20日，中国自动化学会（CAA）公布了2024中国自动化学会高等教育（本科、研究生）教学成果评价结果。学院吴皓教授主持申报的“新工科背景下多元复合驱动的理论类课程教学改革与实践”项目（主要完成人：吴皓、朱文兴、张承慧、李可、姜明顺、臧利林）被评为“一等贡献教学成果”。